Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cald1E9QA15 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms