Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf11E9Q6E5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf11E9Q6E5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms