Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms