Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Susd1E9Q3H4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Susd1E9Q3H4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms