Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tarbp1E9Q368 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tarbp1E9Q368 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms