Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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