Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc171E9Q1U1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms