Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm3250E9Q1M3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms