Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3893E9Q1I1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms