Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc1E9Q043 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc1E9Q043 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms