Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx60E9PZQ1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx60E9PZQ1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms