Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sbf2E9PXF8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms