Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc144bE9PVZ3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc144bE9PVZ3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc144bE9PVZ3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms