Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc62E9PVD1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms