Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim5E9PV98 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms