Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035044E0CXF8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms