Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7Q2

Smim20, Small integral membrane protein 20, mousemouse

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Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim20D3Z7Q2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim20D3Z7Q2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim20D3Z7Q2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim20D3Z7Q2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim20D3Z7Q2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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