Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Vpreb3D3Z6J4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms