Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms