Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3676D3Z236 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms