Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
3425401B19RikD3Z1D3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms