Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem200bD3Z0P8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms