Protein–RNA interactions for Protein: D3YV89

Mmp27, Matrix metalloproteinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp27D3YV89 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms