Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm4950D3YUM8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm4950D3YUM8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm4950D3YUM8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm4950D3YUM8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4950D3YUM8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm4950D3YUM8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm4950D3YUM8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm4950D3YUM8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Gm4950D3YUM8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm4950D3YUM8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm4950D3YUM8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4950D3YUM8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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