Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CatipB9EKE5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CatipB9EKE5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CatipB9EKE5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CatipB9EKE5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatipB9EKE5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatipB9EKE5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatipB9EKE5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatipB9EKE5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatipB9EKE5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatipB9EKE5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatipB9EKE5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatipB9EKE5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatipB9EKE5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatipB9EKE5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CatipB9EKE5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms