Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r180B9EK86 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms