Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mterf1bB9EJ57 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms