Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnldc1B2RXZ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms