Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc11B2RXC1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms