Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cspp1B2RX88 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms