Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apba1B2RUJ5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.4 ms