Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprbB2RU80 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms