Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zscan5bB2RTN3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms