Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms