Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H60cB1B213 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H60cB1B213 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H60cB1B213 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H60cB1B213 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H60cB1B213 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H60cB1B213 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H60cB1B213 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H60cB1B213 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms