Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3aB1AWZ3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms