Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scml2B1AVB3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms