Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtpruB1AUH1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpruB1AUH1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms