Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprsB0V2N1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprsB0V2N1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms