Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xlr4aA2BI40 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms