Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samt1A2BED8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samt1A2BED8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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