Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1A2ANU3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms