Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam43bA2AM80 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam43bA2AM80 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms