Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc183A2AJB1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms