Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel3A2AHA7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel3A2AHA7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramel3A2AHA7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms