Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ambra1A2AH22 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ambra1A2AH22 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms