Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34dA2AGU5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34dA2AGU5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms