Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms