Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930447F04RikA2AFR2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms