Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb4A2A863 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb4A2A863 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb4A2A863 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb4A2A863 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb4A2A863 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb4A2A863 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb4A2A863 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb4A2A863 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb4A2A863 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb4A2A863 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb4A2A863 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb4A2A863 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms